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【复习笔记】华工考研《830生物化学》知识点笔记之酶(...

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发表于 2022-5-23 09:22:30 | 显示全部楼层 |阅读模式
 
第六章 酶(一)
1、酶与一般催化剂的比较
(1)酶是生物催化剂,反应条件温和,常温常压,中性PH,酶易失活。
(2)酶具有很高催化效率
(3)酶具有高度专一性:
(4)酶活性受调节控制
【1】调节酶的浓度
【2】激素调节
【3】反馈抑制调节
【4】抑制剂、激活剂调节
【5】酶原的激活
【6】共价修饰
【7】别构调控

2、酶的专一性
(一)结构专一性:对底物要求严格。
(1)绝对专一性:只作用一种底物,如脲酶水解尿素。
(2)相对专一性:作用于一类结构相近的底物。
族专一性或基团专一性:对作用键的两端基团,一端要求严格,对另一端要求不严格。如 α-D-葡萄糖苷酶,要求糖苷键一端为葡萄糖,另一端可为果糖(如蔗糖),或葡萄糖(如麦芽糖)。
键专一性:只作用一定的键,对键两端基团无严格要求。如脂酶,蛋白酶。
(二)立体异构专一性:
旋光异构专一性:如只作用L-氨基酸,可用于氨基酸的拆分。
几何异构专一性:如琥珀酸脱氢酶只生成反丁烯二酸。
潜手性识别:对潜手性分子上的原子有识别性,如酵母醇脱氢酶,只作用尼克酰胺环的C4上的HA。
(三)酶作用专一性假说:
(1)锁与钥匙学说:
酶与底物为锁与钥匙的关系。但“刚性模板”无法解释反应物和底物均为酶的底物。
(2)诱导契合假说:
酶与底物分子接近时,酶蛋白受底物分子诱导其构象发生有利于与底物结合的变化,酶与底物在此基础上互补契合,并进行反应

3、米氏方程
(1)1913年Michaelis和Menten提出并推导出表示[S]与v之间定量关系的米氏方程
V =Vmax[S]/Km + [S]
Km:米氏常数,物理意义为反应速率为最大速率Vmax一半时底物的浓度,单位与底物浓度同。  
米氏方程表示Km及Vmax已知时,v~[S]的定量关系。
(2)米氏常数的意义
【1】Km是酶的一个特性常数,Km大小只与酶性质有关,而与酶浓度无关。当底物确定,反应温度,pH及离子强度一定时,Km值为常数,可用来鉴别酶。
【2】不同的酶Km值不同,测定Km要在相同测定条件(pH、温度、离子强度)下进行。
【3】Km值可用于判断酶的专一性和天然产物,若一个酶有几种底物就有几个Km值,其中Km值最小的底物称为该酶的最适底物,又称天然底物。
【4】1 / Km可近似表示酶与底物亲和力的大小。
【5】Km可帮助推断某一代谢反应的方向和途径。Km小的为主要催化方向(正、逆两方向反应Km不同)。
(3)Vmax和k3(kcat)的意义:
酶浓度[E]一定,则对特定底物Vmax为一常数。催化常数 kcat 又称酶的转化数,数值上与k3同,为酶被底物饱和时,每秒钟每个酶分子转换底物的分子数。
大多数酶的kcat 为1~104/sec,见P322 表8-2,为每秒钟酶促反应每微摩尔酶分子转换底物的微摩尔数。kcat越大,酶催化效率越高。
kcat / Km的意义:  
kcat / Km大小可以比较不同酶或同一种酶催化不同底物的催化效率。

4、影响酶催化效率的因素
(一)底物和酶的邻近效应与定向效应。
酶催化反应高效率一重要原因是将分子间反应变为分子内反应。
邻近效应:底物与酶先形成中间体络合物,两分子成一个分子,分子内反应速度比分子间反应速度提高。
定向效应:底物反应基团和酶催化基团正确取位会大大加速反应。P389 表10-3 用二羧酸单苯酯水解相对速度和结构关系实验表明:分子内催化反应,当催化基团羧基与酯键愈邻近并有一定取向,反应速度愈大。每移去一个旋转自由度,反应速度约增加200倍。
(二)底物的形变和诱导契合:
酶使底物分子内敏感键中某些基团的电子云密度增高或降低,产生“电子张力”,底物扭曲而接近过渡态,使反应加速。
溶菌酶作用细菌细胞壁,水解由N-乙酰基葡萄糖胺等构成的糖苷键。溶菌酶与底物结合时会引起糖环构象由椅式变成半椅式,可加速水解。
(三)酸碱催化:
酶为广义酸碱催化。咪唑基既是一个强亲核基团,又是一个有效的广义酸碱催化功能基团,因此蛋白质中His含量虽少,但却占有重要的地位。此外酶蛋白中还有氨基、羧基、巯基、羟基等,都具有广义酸碱催化功能。
(四)共价催化:
有亲核催化或亲电催化。酶在催化过程中形成中间物,P392 表10-5列出形成共价中间物的一些酶。
酶分子中氨基酸侧链上有许多亲核基团如羟基、巯基、咪唑基等,可进攻底物的酰基、磷酰基和糖基等。
(五)金属离子催化:
几乎三分之一的酶催化需要金属离子,金属离子可以与酶紧密结合,也可以是松散结合。
金属作用与H+相似,但由于带正电荷更多而作用更强,且容易维持一定浓度。② 金属离子可通过电荷屏蔽作用而促进反应。如Mg++屏蔽ATP中磷酸基负电荷,消除负电荷排斥作用而加速激酶的反应,此时激酶真正作用底物是Mg2+-ATP,而不是ATP,见P394。③ 金属离子通过水的离子化,使水分子更具酸性,促进亲核催化。④ 许多氧化还原酶都含有金属的辅基。
(六)多元催化和协同效应:
酶催化反应时常常是几个功能团适当排列共同作用。如胰凝乳蛋白酶活性中心处三个氨基酸残基组成“电荷中继网”,催化肽键水解;核糖核酸酶催化水解时,His12起广义碱催化作用,接受一个质子,而His119起广义酸作用,和磷酸的氧原子形成氢键。
(七)微环境影响:
酶促反应在酶表面的疏水裂缝(活性中心)中进行,如同反应在有机溶剂中进行,反应基团不为溶剂化,亲核亲电反应均可加速。如溶菌酶Glu35的羧基在非极性区,催化功能增速3×106倍。模拟酶由此设计胶束模拟酶和环糊精等。




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