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相关科目:830生物化学 相关知识点:蛋白质(1)
#1、蛋白质(1) 1、20种氨基酸的名称和简写以及必需氨基酸的种类
1. 1氨基酸 (一) 蛋白质水解最后成为氨基酸混合物 酸水解 得19种 L-AA,色氨酸破坏。 碱水解 得色氨酸,其余氨基酸消旋破坏。 酶水解 不消旋破坏,但水解不彻底。 (二) α-氨基酸的一般结构 生物体内已发现氨基酸180种,常见氨基酸20种
1.2氨基酸的分类: 常见蛋白质氨基酸,不常见蛋白质氨基酸,非蛋白氨基酸 (一) 常见蛋白质氨基酸,或称基本氨基酸。 每个氨基酸可用三个字母或单字母简写表示。按侧链R基不同进行分类。
(1) 按R基化学结构分类 1. 脂肪族氨基酸15个 ①. 中性氨基酸5个 甘氨酸 Glycine 氨基乙酸 Gly G 无旋光 丙氨酸 Alanine α-氨基丙酸 Ala A 缬氨酸 Valine α-氨基-β-甲基丁酸 Val V 亮氨酸 Leusine α-氨基-γ-甲基戊酸 Leu L 异亮氨酸 Isoleucine α-氨基-β-甲基戊酸 Ile I ②. 含羟基或硫氨基酸4个 丝氨酸 Serine α-氨基-β-羟基丙酸 Ser S 苏氨酸 Threonine α-氨基-β-羟基丁酸 Thr T 半胱氨酸 Cysteine α-氨基-β-基丙酸 Cys C 甲硫氨酸 Methionine α-氨基-γ-甲硫基丁酸 Met M ③.酸性氨基酸及其酰胺4个 天冬氨酸Aspartic acid α-氨基丁二酸 Asp D 谷氨酸 Glutamic acid α-氨基戊二酸 Glu E 天冬酰胺 Asparagine α-氨基丁二酸一酰胺 Asn N 谷氨酸胺 Glutamine α-氨基戊二酸一酰胺 Gln Q ④. 碱性氨基酸2个 赖氨酸 Lysine α,ε-二氨基已酸 Lys K 精氨酸 Arginine α-氨基-δ-胍基戊酸 Arg R
2. 芳香族氨基酸3个 苯丙氨酸 Phenylalanine α-氨基-β-苯基丙酸 Phe F 酪氨酸 Tyrosine α-氨基-β-对羟苯基丙酸 Tyr Y 色氨酸 Tryptophan α-氨基-β-吲哚基丙酸 Trp W
3. 杂环族氨基酸2个 组氨酸 Histidine α-氨基-β-咪唑基丙酸 His H 脯氨酸 Proline α-吡咯烷羧酸 Pro P
(2) 按R基极性性质分类 1. 非极性R基8个 Ala(A) Val(V) Leu(L) Ile(I) Pro(P) Phe(F) Trp(W) Met(M) 2. 极性不带电R基7个 Gly(G) Ser(S) Thr(T) Cys(C) Tyr(Y) Asn(N) Gln(Q) 3. 带正电荷R基3个 Lys(K) Arg(R) His(H) 4.带负电荷R基2个 Asp(D) Glu(E) 另外 Asx(B):Asp(D),Asn(N) Glx(Z):Glu(E),Gln(Q) 两个Cys常氧化形成胱氨酸Cystie
(二)不常见蛋白质氨基酸 为相应常见氨基酸修饰而来,如:5-羟赖氨酸,4-羟哺氨酸,γ-羧基谷氨酸,焦谷氨酸,磷酸丝氨酸,甲状腺素等。
(三)非蛋白氨基酸 P129 1. L型α-氨基酸衍生物 P128 2. β、γ或δ-氨基酸 3. D-氨基酸,如D-Glu和D-Ala 常见有:肌氨酸(N-甲基甘氨酸),β-丙氨酸,γ-氨基丁酸,瓜氨酸,鸟氨酸,高半胱氨酸。
2、氨基酸的化学反应 1.3 氨基酸的酸碱化学 (一) 等电点 氨基酸或其他带电颗粒处于净电荷为零的兼性离子状态时介质的pH值,用pI表示,又称等电pH。 对于Gly ,pI=5.97,为曲线A和曲线B之间的拐点,Gly为兼性离子,净电荷为零。 等电点pH值计算: pI=1/2(pKa+)+pKa) Gly pI=1/2(2.34+9.60)=5.97 对于带可解离R基的氨基酸 如Asp的pKa,pKa1=2.09 pKa2=3.86 pKa3=9.82等电点pIP=1/2(pKa+pKa2)=1/2(2.09+3.86)=2.98 同理推出 Lys pI=9.74
1. 4 氨基酸的光学性质 (一)旋光性 一个无旋光 Gly 17个含一个不对称碳原子,两个含两个不对称碳原子 Thr和Ile,有四种光学异构体。 胱氨酸分子内部对称有内消旋体,有三种异构体。 比旋光为氨基酸物理常数之一,但随pH值变化常见氨基酸比旋光度可用来鉴别氨基酸,P144表 3-4 (二) 氨基酸的紫外吸收 λmax(nm) ε(摩尔消光系数) Phe 257 2.0×102 Tyr 275 1.4×103 Tvp 280 5.6×103 蛋白质在280nm波长下测光吸收,光吸收值越大,相对纯度越高,常用在蛋白质提纯过程。
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